山羊p300基因生物信息学分析及其在主要器官中的表达

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20210150

浙江农业科学 ›› 2021, Vol. 62 ›› Issue (1): 159-163.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20210150

山羊p300基因生物信息学分析及其在主要器官中的表达

李晓璇¹(), 童旭¹^,², 张丹丹¹^,², 张冰¹, 申屠璐燕¹^,², 孙梦娟¹^,², 齐昕¹^,², 宁伟¹^,², 张运海¹^,², 曹祖兵¹^,²^,^*()

1.安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥 230036
2.地方畜禽遗传资源保护与生物育种安徽省重点实验室,安徽合肥 230036

收稿日期:2020-08-27 出版日期:2021-01-11 发布日期:2021-01-05
通讯作者: 曹祖兵
作者简介:曹祖兵(1983—),男,安徽淮南人,副教授,博士,主要从事动物胚胎工程研究工作,E-mail: zubingcao@ahau.edu.cn。
李晓璇(1997—),女,安徽淮南人,本科生,研究方向为动物科学,E-mail: 742369232@qq.com。
基金资助:
安徽农业大学稳定与引进人才科研基金(YJ2016-10)

Received:2020-08-27 Online:2021-01-11 Published:2021-01-05

摘要/Abstract

摘要：

为探讨山羊p300基因的基因组特征及其在主要器官中的表达,本研究从染色体定位、基因结构、序列比对等方面对p300基因进行生物信息学分析,并通过实时定量PCR技术检测了p300基因在三月龄胎羊八种不同器官的表达情况。实验表明,p300基因定位于5号染色体,包含31个外显子,跨越长度63 766 bp,mRNA总长9 571 bp,CDS全长7 235 bp,编码2 411个氨基酸。p300在物种间保守性较高,其中山羊与绵羊同源性最高。此外,p300在山羊的8种器官中均有表达,且在心脏中相对表达量最高。

关键词: 山羊, p300, 主要器官, 生物信息学, 基因表达

中图分类号:

S827

李晓璇, 童旭, 张丹丹, 张冰, 申屠璐燕, 孙梦娟, 齐昕, 宁伟, 张运海, 曹祖兵. 山羊p300基因生物信息学分析及其在主要器官中的表达[J]. 浙江农业科学, 2021, 62(1): 159-163.

图/表 8

图1 山羊p300基因结构

图2 p300在不同物种间的进化关系(CDS)

图3 p300在不同物种间的进化关系(AA)

图4 各器官RNA琼脂糖凝胶电泳图

表1 8种器官RNA浓度

器官名称	浓度/(ng·μL^-1)	D₂₆₀/D₂₈₀	D₂₆₀/D₂₃₀
心	228.9	2.01	1.69
肝	145.4	1.99	1.82
脾	658.8	2.00	2.03
肺	218.6	1.98	1.51
肾	466.3	2.00	2.11
睾丸	287.9	2.04	1.95
卵巢	237.5	2.02	1.99
小肠	237.3	1.93	1.27

图5 琼脂糖凝胶电泳图 Marker—DNA分子标记;1—p300-1 PCR产物;2—p300-2 PCR产物;3—p300-3 PCR产物。

图6 实时荧光定量PCR熔解曲线

图7 p300在胎羊8种主要器官中的表达量不同数据上没有相同小写字母表示差异显著(P<0.05)。

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