doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20201115

Abstract

CLC Number:

S567

Figures/Tables 4

References 20

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碱基	数量	频率/ (个·Mb^-1)	密度/ (bp·Mb^-1)	总长度/ bp	平均长度/bp
单碱基	10 2412	101.55	1 528.334	1 424 865	13.91
二碱基	74 066	73.44	1 698.407	1 583 424	21.38
三碱基	28 822	28.58	612.680	571 201	19.82
四碱基	7 571	7.51	130.713	121 863	16.10
五碱基	1 999	1.98	41.560	38 746	19.38
六碱基	791	0.78	20.233	18 863	23.85

碱基	数量	频率/ (个·Mb^-1)	密度/ (bp·Mb^-1)	总长度/ bp	平均长度/bp
单碱基	10 2412	101.55	1 528.334	1 424 865	13.91
二碱基	74 066	73.44	1 698.407	1 583 424	21.38
三碱基	28 822	28.58	612.680	571 201	19.82
四碱基	7 571	7.51	130.713	121 863	16.10
五碱基	1 999	1.98	41.560	38 746	19.38
六碱基	791	0.78	20.233	18 863	23.85

重复拷贝类别	数量	频率/ (个·Mb^-1)	密度/ (bp·Mb^-1)
A	8 9499	88.74	1 314.44
C	1 2913	12.8	213.89
AG	3 8352	38.03	919.64
AT	2 8175	27.94	609.73
AC	7481	7.42	168.12
CG	58	0.06	0.92
AGC	173	0.19	2.88
ACG	184	0.20	3.03
CCG	277	0.30	4.62
ACT	892	0.96	15.74
AGT	901	0.97	15.34
ACC	1 089	1.17	17.3
AGG	1 118	1.20	18.53
AAG	4 171	4.47	77.6
AAC	9 096	9.76	161.91
AAT	10 921	11.71	295.72

重复拷贝类别	数量	频率/ (个·Mb^-1)	密度/ (bp·Mb^-1)
A	8 9499	88.74	1 314.44
C	1 2913	12.8	213.89
AG	3 8352	38.03	919.64
AT	2 8175	27.94	609.73
AC	7481	7.42	168.12
CG	58	0.06	0.92
AGC	173	0.19	2.88
ACG	184	0.20	3.03
CCG	277	0.30	4.62
ACT	892	0.96	15.74
AGT	901	0.97	15.34
ACC	1 089	1.17	17.3
AGG	1 118	1.20	18.53
AAG	4 171	4.47	77.6
AAC	9 096	9.76	161.91
AAT	10 921	11.71	295.72

重复拷贝类别	数量	频率/ (个·Mb^-1)	密度/ (bp·Mb^-1)
AAAT	4419	4.74	76.05
AATT	846	0.91	14.4
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ACAT	302	0.32	5.6
AGGG	272	0.29	4.85
AGAT	234	0.25	4.65
AAAC	230	0.25	3.9
AACT	118	0.13	1.96
AATC	114	0.12	1.96
ACTC	92	0.10	1.58
CCGG	92	0.10	1.48
AAGT	84	0.09	1.39
AATG	81	0.09	1.31
ACGT	71	0.08	1.16
AAGG	42	0.05	0.69
AACC	36	0.04	0.59

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重复拷贝类别	数量	频率/(个·Mb^-1)	密度/(bp·Mb^-1)	重复拷贝类别	数量	频率/(个·Mb^-1)	密度/(bp·Mb^-1)
AAATA	824	0.88	17.09	AATAAA	78	0.08	1.91
AAATT	142	0.15	2.94	AGAGGG	50	0.05	1.31
AAAGA	116	0.12	2.4	AAGAAA	36	0.04	0.88
AAACA	89	0.10	1.85	ATTATA	33	0.04	0.83
AGCTC	92	0.10	1.85	AGAAGG	19	0.02	0.46
AATAT	81	0.09	1.83	AAACAA	18	0.02	0.44
AGTAT	72	0.08	1.6	AGAGGA	17	0.02	0.43
AAGAG	71	0.08	1.45	CCACCT	16	0.02	0.41
AGCTG	50	0.05	1	AACCCT	14	0.02	0.34
AGCCC	47	0.05	0.94	AAATAT	13	0.01	0.33