天台铁线莲花色变异的转录组分析

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20213346

浙江农业科学 ›› 2022, Vol. 63 ›› Issue (4): 751-755.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20213346

天台铁线莲花色变异的转录组分析

叶友菊(), 胡青荻, 郑坚, 马晓华, 张旭乐, 钱仁卷^*()

浙江省亚热带作物研究所温州市资源植物创新利用重点实验室,浙江温州 325005

收稿日期:2022-01-22 出版日期:2022-04-11 发布日期:2022-04-06
通讯作者: 钱仁卷
作者简介:钱仁卷(1981—),男,浙江温州人,副研究员,硕士,研究方向为观赏植物培育,E-mail: qrj@njfu.edu.cn。
叶友菊(1994—),女,安徽当涂人,助理研究员,博士,研究方向为观赏植物育种,E-mail: yeyj@njfu.edu.cn。
基金资助:
浙江省自然科学基金(LY19C150002);浙江省重点研发计划(2019C02036);浙江省农业新品种重大专项花卉育种专项(2021C02071-6);浙江省林业发展和资源保护项目

Received:2022-01-22 Online:2022-04-11 Published:2022-04-06

摘要/Abstract

摘要：

天台铁线莲是中国特有的铁线莲属植物,为大花平展型藤本花卉,具有较高观赏价值,花色通常白色。项目组在天台铁线莲引种驯化过程中发现了花萼呈现白色和紫色相间以及花萼全部为蓝紫色的多个花色变异类型。为进一步探究影响花色变异机制,以白色原种天台铁线莲为对照进行了转录组测序。测序结果共获得136.03 Gb的clean data。通过对差异表达基因分析,结果显示,白色(TTCB)和蓝紫色(TTSZ)花之间存在着最多的差异基因。通过GO功能分类,可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类。在TTCB 与 TTJ(紫色相间)的富集结果中,DEGs主要富集在生物合成和代谢过程方面,而在TTCB 与 TTJD(淡紫色相间)、TTCB 与 TTJZ(蓝紫色相间)和TTCB 与 TTSZ的富集结果中,DEGs主要富集在代谢过程方面。通过KEGG pathway分析表明,对天台铁线莲花色影响最为重要的花青素合成途径,在TTCB 与 TTSZ中达到最多的差异基因数量17个,而在TTCB 与 TTJD、TTCB 与 TTJ和TTJ 与 TTSZ中分别是6、10和16个,表明随着花色差异增大参与花青素合成的差异基因越多。本研究丰富了天台铁线莲的转录组信息,为进一步揭示天台铁线莲花色变异相关分子机制提供科学依据。

关键词: 天台铁线莲, 花色变异, 转录组测序, 差异表达基因

中图分类号:

S68
Q756

叶友菊, 胡青荻, 郑坚, 马晓华, 张旭乐, 钱仁卷. 天台铁线莲花色变异的转录组分析[J]. 浙江农业科学, 2022, 63(4): 751-755.

图/表 6

参考文献 24

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样品	原始数据	干净数据	Q30比值/%	GC含量/%
TTCB1	68 712 788	68 165 632	93.64	45.24
TTCB2	61 618 042	61 137 866	93.37	45.42
TTCB3	74 259 512	73 735 828	94.06	45.43
TTJD1	64 066 038	63 627 592	94.12	45.17
TTJD2	67 325 912	66 826 140	94.26	45.24
TTJD3	68 402 578	67 863 326	93.96	45.20
TTJ1	56 044 472	55 301 450	93.32	45.19
TTJ2	57 863 148	57 314 786	93.75	45.65
TTJ3	56 184 658	55 441 024	92.93	45.58
TTJZ1	56 112 838	55 150 520	93.57	45.18
TTJZ2	56 322 312	55 573 182	93.80	45.06
TTJZ3	59 558 372	58 991 728	93.58	45.39
TTSZ1	56 324 316	55 535 892	93.51	45.48
TTSZ2	55 661 584	54 669 952	94.03	45.70
TTSZ3	59 666 386	59 095 466	93.45	45.51

样品	原始数据	干净数据	Q30比值/%	GC含量/%
TTCB1	68 712 788	68 165 632	93.64	45.24
TTCB2	61 618 042	61 137 866	93.37	45.42
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TTJ3	56 184 658	55 441 024	92.93	45.58
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TTJZ2	56 322 312	55 573 182	93.80	45.06
TTJZ3	59 558 372	58 991 728	93.58	45.39
TTSZ1	56 324 316	55 535 892	93.51	45.48
TTSZ2	55 661 584	54 669 952	94.03	45.70
TTSZ3	59 666 386	59 095 466	93.45	45.51

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