浙江农业科学 ›› 2020, Vol. 61 ›› Issue (11): 2236-2240.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20201114

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华重楼根茎内生细菌群落多样性及其功能预测

洪春桃(), 黄宗兴, 张玲菊, 魏斌, 章建红*()   

  1. 宁波市农业科学研究院,浙江 宁波 315040
  • 收稿日期:2020-08-29 出版日期:2020-11-11 发布日期:2020-11-11
  • 通讯作者: 章建红
  • 作者简介:章建红(1976—),男,浙江金华人,教授级工程师,硕士,从事资源植物及林木种苗研究工作,E-mail: nbjianhong@163.com
    洪春桃(1989—),女,浙江宁波人,助理研究员,硕士,从事资源植物研究与利用工作,E-mail: 15067436540@139.com
  • 基金资助:
    宁波市科技富民项目(2017C10064)

  • Received:2020-08-29 Online:2020-11-11 Published:2020-11-11

摘要:

内生菌广泛存在于植物组织内部,是植物微生态系统的重要组成部分。为了解华重楼根茎内生细菌的群落组成和其潜在的生物学功能,采用高通量16S rRNA测序技术分析了2 年生华重楼根茎内生细菌群落多样性,并通过PICRUSt分析,评价了其内生细菌的潜在功能。结果表明,5个华重楼根茎共获得112 267条16S rRNA V3-V4区高质量序列片段,内生细菌群落的α-多样性Chao1指数、Observed species指数、PD whole tree指数和Shannon指数的平均值分别为3417.7、748.0、40.7和8.3;其优势门为厚壁菌门和放线菌门,优势变形菌纲为γ-变形菌纲和α-变形菌纲,优势菌属为Dubosiella(占比为5.61%)。16S rRNA功能预测结果显示,华重楼根茎内生细菌功能主要涉及膜运输、能量代谢、碳水化合物代谢、氨基酸代谢和辅酶因子、维生素代谢等。华重楼根茎内生细菌群落多样性丰富,具有大量代谢相关的有益菌。

关键词: 华重楼, 根状茎, 内生菌, 16S rRNA测序技术

中图分类号: