Factor and cluster analysis of quantitative characters in Bombyx mori germplasm resources

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20230733

Abstract

Abstract:

Using factor analysis and variety clustering methods to comprehensively evaluate Bombyx mori germplasm resources can improve the efficiency of variety identification and facilitate the rational and effective selection of breeding parents, providing important references for breeding work. With 60 Bombyx mori germplasm resources as the tested materials, their main quantitative traits were subjected to factor analysis, and cluster analysis was conducted based on their Euclidean distance. The cumulative contribution rate of the first 5 common factors of the quantitative traits of the tested Bombyx mori germplasm resources reached 92.754 5%, among which the cocoon silk yield composition factor was the first common factor with a maximum contribution rate of 45.954 8%; the vitality composition factor was the second common factor with a contribution rate of 18.703 3%; the third common factor was the reelability factor with a contribution rate of 12.561 2%; the fourth and fifth common factors were the hatching rate factor and the cocoon filament size factor with contribution rates of 9.795 6% and 5.739 6%, respectively. In the Euclidean distance clustering diagram, the 60 germplasm resources can be divided into three main groups, namely, a high-quality and high-yielding group composed of 28 germplasm resources, a general group composed of 19 germplasm resources, and a special trait genetic material group composed of 13 germplasm resources. The first and second common factors, cocoon silk yield and vitality, are two main indicators in Bombyx mori breeding, and selection and improvement are made based on a few common factors and special factors in each generation breeding process to improve breeding efficiency. Cluster analysis can reveal the relative genetic distance between different Bombyx mori germplasm resources, and provide a scientific and objective basis for the hybrid breeding, utilization and improvement of Bombyx mori germplasm resources.

Key words: Bombyx mori, quantitative characters, factor analysis, cluster analysis

CLC Number:

S881

WANG Anjie, HUA Lifeng, ZHOU Lixia, ZHANG Fenglin, WANG Zhaohong. Factor and cluster analysis of quantitative characters in Bombyx mori germplasm resources[J]. Journal of Zhejiang Agricultural Sciences, 2024, 65(10): 2470-2476.

Figures/Tables 8

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序号	品种名	来源	序号	品种名	来源	序号	品种名	来源
1	951	安徽	21	鲁11	山东	41	限黄日	日本
2	镜月1号	日本	22	鲁17	山东	42	8612	山东
3	镜和	日本	23	鲁19	山东	43	苏16(鲁)	山东
4	9501	四川	24	827鲁	山东	44	Alb Cislau	罗马尼亚
5	9601	山东	25	荧光	山东	45	罗卵限	罗马尼亚
6	9603	山东	26	协1号	河南	46	罗五斑	罗马尼亚
7	菁松	江苏	27	鲁1	山东	47	东春2	山东
8	8401	山东	28	鲁10	山东	48	新春	山东
9	荆研	湖北	29	三眠B	江苏	49	白云	浙江
10	苏17(鲁)	山东	30	芊春	山东	50	大团圆	江苏
11	757	山东	31	秋菊	山东	51	大造	江苏
12	丰一	江苏	32	9531	山东	52	re黑	日本
13	华四	山东	33	春兰	山东	53	os	江苏
14	限黄中	日本	34	知日	山东	54	od	江苏
15	薪杭	浙江	35	952	安徽	55	Sch	江苏
16	中3	安徽	36	春岭1号	日本	56	协2号	河南
17	901	江苏	37	锦秋	日本	57	春日	浙江
18	中17	山东	38	皓月	江苏	58	92	山东
19	菁L白	山东	39	东四	山东	59	春玉	山东
20	L菁	山东	40	楚玉	湖北	60	8214鲁	山东

序号	品种名	来源	序号	品种名	来源	序号	品种名	来源
1	951	安徽	21	鲁11	山东	41	限黄日	日本
2	镜月1号	日本	22	鲁17	山东	42	8612	山东
3	镜和	日本	23	鲁19	山东	43	苏16(鲁)	山东
4	9501	四川	24	827鲁	山东	44	Alb Cislau	罗马尼亚
5	9601	山东	25	荧光	山东	45	罗卵限	罗马尼亚
6	9603	山东	26	协1号	河南	46	罗五斑	罗马尼亚
7	菁松	江苏	27	鲁1	山东	47	东春2	山东
8	8401	山东	28	鲁10	山东	48	新春	山东
9	荆研	湖北	29	三眠B	江苏	49	白云	浙江
10	苏17(鲁)	山东	30	芊春	山东	50	大团圆	江苏
11	757	山东	31	秋菊	山东	51	大造	江苏
12	丰一	江苏	32	9531	山东	52	re黑	日本
13	华四	山东	33	春兰	山东	53	os	江苏
14	限黄中	日本	34	知日	山东	54	od	江苏
15	薪杭	浙江	35	952	安徽	55	Sch	江苏
16	中3	安徽	36	春岭1号	日本	56	协2号	河南
17	901	江苏	37	锦秋	日本	57	春日	浙江
18	中17	山东	38	皓月	江苏	58	92	山东
19	菁L白	山东	39	东四	山东	59	春玉	山东
20	L菁	山东	40	楚玉	湖北	60	8214鲁	山东

因子序号	特征值	贡献率/%	累计贡献率/%
1	3.676 4	45.954 8	45.954 8
2	1.496 3	18.703 3	64.658 1
3	1.004 9	12.561 2	77.219 3
4	0.783 6	9.795 6	87.014 9
5	0.459 2	5.739 6	92.754 5
6	0.341 7	4.270 9	97.025 4
7	0.145 2	1.815 0	98.840 4
8	0.092 8	1.159 6	100.000 0

因子序号	特征值	贡献率/%	累计贡献率/%
1	3.676 4	45.954 8	45.954 8
2	1.496 3	18.703 3	64.658 1
3	1.004 9	12.561 2	77.219 3
4	0.783 6	9.795 6	87.014 9
5	0.459 2	5.739 6	92.754 5
6	0.341 7	4.270 9	97.025 4
7	0.145 2	1.815 0	98.840 4
8	0.092 8	1.159 6	100.000 0

性状	因子1	因子2	因子3	因子4	因子5	共同度	特殊方差
x₁	0.664 1	0.064 3	0.490 3	0.456 3	0.182 2	0.926 9	0.073 1
x₂	0.448 5	-0.666 3	0.395 9	0.183 3	-0.235 8	0.891 0	0.109 0
x₃	-0.169 4	0.863 7	0.192 1	0.275 5	0.104 1	0.898 3	0.101 7
x₄	0.921 6	0.039 2	0.057 2	-0.177 4	0.109 6	0.897 6	0.102 4
x₅	0.814 7	0.364 4	-0.170 3	-0.256 8	-0.158 0	0.916 4	0.083 6
x₆	0.829 1	0.330 8	-0.039 1	0.023 2	-0.386 4	0.948 2	0.051 8
x₇	0.358 2	-0.164 4	-0.724 2	0.562 6	0.024 0	0.996 9	0.003 1
x₈	0.822 7	-0.177 3	-0.112 8	-0.226 8	0.415 6	0.945 1	0.054 9
特征值	3.676 4	1.496 3	1.004 9	0.783 6	0.459 2
累计贡献	0.459 5	0.646 6	0.772 2	0.870 1	0.927 5