灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20200550

浙江农业科学 ›› 2020, Vol. 61 ›› Issue (5): 967-973.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20200550

灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估

何金宇^1,2, 刘玉洋^1,2, 徐靖^3,4, 王晓彤^3,4, 陈晓俊^3,4, 王慧中^1,2,*, 卢江杰^1,2,*

1.杭州师范大学生命与环境科学学院,浙江杭州 310036;
2.浙江省药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室,浙江杭州 310036;
3.浙江省珍稀植物药工程技术研究中心,浙江武义 321200;
4.浙江寿仙谷医药股份有限公司,浙江武义 321200

收稿日期:2020-02-11 出版日期:2020-05-11
通讯作者: 卢江杰(1982—),男,浙江临安人,讲师,博士,从事药用植物分子生物学研究工作,E-mail: lujj@hznu.edu.cn;王慧中(1962—),男,浙江义乌人,教授,博士,从事中药资源和开发研究工作,E-mail: whz62@163.com。
作者简介:何金宇(1995—),男,辽宁锦州人,在读硕士,研究方向为药用植物分子生物学,E-mail: yuyang19911026@sina.cn。
基金资助:
浙江省农业(中药材)新品种选育重大科技专项(2016C02057)

Received:2020-02-11 Online:2020-05-11

摘要/Abstract

摘要： 灵芝是我国传统“九大仙草”之一的名贵中药材,具有调节免疫、抗肿瘤、抗病毒、降血糖、抗氧化等药理活性。灵芝种类繁多,品质参差不齐,种质资源鉴定以及新品种培育是灵芝育种研究的重要内容之一。简单重复序列标记(SSR)技术可从DNA分子层面对灵芝种质资源进行鉴定和遗传多样性评估,有效避免了环境因素和人为因素的干扰,对推动灵芝产业良性发展具有重要意义。本研究通过分析灵芝全基因组信息,利用MISA软件扫描到4 038个SSR位点,共设计出1 442对引物,随机合成50对引物并用2个灵芝DNA进行验证,发现其中44对引物为真实SSR引物,占总数的88%。我们利用筛选出的44对SSR引物对11份灵芝种质资源进行遗传多样性评估,结果发现,11份灵芝材料间的遗传距离在0.120~0.962,其中GL-2号和GL-11号、GL-3号和GL-11号灵芝材料间遗传距离最大(0.962),GL-7号和GL-8号灵芝材料间遗传距离最小(0.120)。通过聚类分析对11份灵芝材料进行区分,其中野生的菌种及其后代(第3类)可以很好地与栽培菌种及其后代(第1类和第2类)区分,但是相同原始菌种LZ32来源的不同世代家系可划分为2大类,这可能是原始菌种LZ32不纯造成的结果。通过本研究证明灵芝全基因组SSR分子标记技术可用于种质资源鉴定和遗传多样性分析。

关键词: 灵芝, 全基因组, SSR标记, 种质资源, 遗传多样性

中图分类号:

S567.3⁺1

何金宇, 刘玉洋, 徐靖, 王晓彤, 陈晓俊, 王慧中, 卢江杰. 灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 967-973.

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