一种山桐子高质量DNA提取方法

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20190951

浙江农业科学 ›› 2019, Vol. 60 ›› Issue (9): 1647-1650.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20190951

一种山桐子高质量DNA提取方法

徐阳^1,2, 龚榜初^1,2,*, 吴开云^1,2, 白杰健³

1.中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江杭州 311400;
2.浙江省林木育种技术研究重点实验室,浙江杭州 311400;
3.青川县林业和园林局,四川广元 628100

收稿日期:2019-06-26 出版日期:2019-09-11
通讯作者: 龚榜初(1964—),男,湖南娄底人,研究员,硕士,研究方向为经济林高效栽培与育种,E-mail:gongbc@126.com。
作者简介:徐阳(1986—),男,安徽阜阳人,助理研究员,博士,研究方向为经济林高效栽培与育种,E-mail: xuyang198610@163.com。
基金资助:
“十二五”国家科技计划(2015BAD15B02)

Received:2019-06-26 Online:2019-09-11

摘要/Abstract

摘要： 山桐子富含大量初生与次生代谢产物,常规方法提取高质量DNA比较困难。该文以CTAB法为框架,裂解前进行PEG洗脱,并优化与简化后续CTAB法操作步骤,形成适宜山桐子高质量DNA提取的改良CTAB法。在此基础上,该文以山桐子幼叶为材料,比较SDS法、CTAB法、试剂盒法、改良CTAB法提取山桐子DNA效果。结果显示,改良CTAB法提取的山桐子DNA浓度高、纯度高,DNA浓度可高达417.5~470.5 ng·μL^-1,平均为438.93 ng·μL^-1,为试剂盒法的8.5倍;所提各样本DNA蛋白质污染、DNA糖类与盐污染得到较好的控制,DNA完整,DNA质量显著优于其他方法。通过本文改良CTAB法,提取的山桐子DNA可以满足简单重复序列(SSR)标记分型、简化基因组测序等相关分子试验所需,为山桐子分子生物学的开展提供了基础。

中图分类号:

S794.9

徐阳, 龚榜初, 吴开云, 白杰健. 一种山桐子高质量DNA提取方法[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(9): 1647-1650.

参考文献

[1] 郑小江. 山桐子产品正式更名为“油葡萄”产品[J]. 中国林业产业, 2018 (增刊2):59-60.
[2] 李大伟, 龚榜初, 白杰建, 等. 山桐子天然群体表型遗传多样性研究[J]. 湖南农业科学, 2010(11): 7-10.
[3] 江锡兵, 龚榜初, 李大伟, 等. 山桐子自然群体表型性状变异分析[J]. 林业科学研究, 2013, 26(1): 113-117.
[4] 吴开云, 龚榜初, 徐阳, 等. 山桐子种质资源收集及生物学特性的初步评价[C]//“木本粮油产业发展森林食品质量安全”学术研讨会暨华东六省一市林学会学术年会论文集.杭州, 2015: 212.
[5] 刘芙蓉, 罗建勋, 杨马进. 山桐子的地理分布及其潜在适宜栽培区区划[J]. 林业科学研究, 2017, 30(6): 1028-1033.
[6] 龚榜初, 李大伟, 江锡兵, 等. 不同产地山桐子果实含油率及其理化指标变异分析[J]. 西北植物学报, 2012, 32(8): 1680-1685.
[7] 龚榜初, 李大伟, 江锡兵, 等. 不同种源山桐子果实脂肪酸组成变异分析[J]. 植物生理学报, 2012, 48(5): 505-510.
[8] 左蕾蕾. 毛叶山桐子用于保健食品的可行性研究初探[J]. 轻工科技, 2014, 30(3): 10-12.
[9] 吴全珍. 我国毛叶山桐子开发利用回顾和展望[J]. 中国油脂, 2011, 36(6): 54-57.
[10] 李欣. 我国山桐子产业的现状与前景[J]. 中国野生植物资源, 2018, 37(6): 73-75.
[11] 江锡兵, 龚榜初, 李大伟, 等. 山桐子实生优株选择研究初报[J]. 植物遗传资源学报, 2014, 15(4): 738-745.
[12] 昝鹏, 张琳, 祖元刚, 等. 山桐子(Idesia polycarpa Maxim)果实多酚的抗炎、抗菌活性研究[J]. 植物研究, 2016, 36(6): 955-960.
[13] 董娜, 唐晓姗, 唐琳. 毛叶山桐子性别相关ISSR分子标记的筛选与分析[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2016, 53(2): 465-470.
[14] 许婉芳. 去除顽拗植物DNA提取过程中干扰物质的方法[J]. 闽西职业大学学报, 2002, 4(3): 55-57.
[15] 李娜, 姚民, 梅兰菊, 等. 基于山桐子转录组序列的SSR分子标记开发[J]. 应用与环境生物学报, 2017, 23(5): 952-958.
[16] PICH U, SCHUBERT I.Midiprep method for isolation of DNA from plants with a high content of polyphenolics[J]. Nucleic Acids Research, 1993, 21(14): 3328-3330.
[17] DOYLE J J T, DOYLE J L. Isolation of plant DNA from fresh tissue[J]. Focus, 1990, 12(1):13-15.
[18] 王鹏凯, 陈金慧, 肖娇, 等.鹅掌楸属植物高质量基因组DNA提取方法研究[EB/OL]. 分子植物育种, 2011, 9: 1203-1208.10.5376/mpb.cn.2011.09.0028.
[19] KOBAYASHI N, HORIKOSHI T, KATSUYAMA H, et al.A simple and efficient DNA extraction method for plants, especially woody plants[J]. Plant Tissue Culture and Biotechnology, 1998, 4(2): 76-80.
[20] SUN X W, LIU D Y, ZHANG X F, et al.SLAF-seq: an efficient method of large-scale de novo SNP discovery and genotyping using high-throughput sequencing[J]. PLoS One, 2013, 8(3): e58700.

一种山桐子高质量DNA提取方法

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	王登亮, 吴雪珍, 刘春荣, 郑雪良, 刘丽丽, 姜翔鹤. 高钾胁迫对椪柑果园土壤和叶片营养的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(1): 49-51.
[2]	孙玉燕, 范敏, 何艳军. 西瓜炭疽病菌离体叶片接种鉴定技术[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(8): 1460-1462.
[3]	王建萍, 李公存, 沙玉芬, 顾亮, 刘笑宏, 苏佳明. 蓝莓叶片的培养试验[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(4): 622-624.
[4]	胡绍泉, 周艳虹. 不同光质及补光时间对东方百合植株生长的影响[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(3): 469-472.
[5]	陈修斌, 杨彬, 许耀照, 李翊华, 祖廷勋. 有机无机肥配施对温室辣椒生理特性与产量品质的影响[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(2): 220-223.
[6]	付双彬, 池梦薇, 杨燕萍, 姚丽娟, 周庄. 外源激素对台闽苣苔叶片分化及再生的影响[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(12): 2209-2212.
[7]	孙晓伟, 姚健, 王京, 李洪亮, 丁丽芳, 王雪芬, 林智博, 李建华. 不同成熟度对烤烟上部叶组织结构和品质的影响[J]. 浙江农业科学, 2017, 58(12): 2249-2251.
[8]	陈巍1,4，郭秀珠1，张启2，黄品湖1，梁森苗3，郑锡良3，戚行江3*. 硼肥对早佳杨梅果实和叶片的影响 [J]. 浙江农业科学, 2016, 1(5): 710-.
[9]	欧成川，郑伟，王谈笑，陈菁，王炜，徐晓丹*. 钩苞大丁草的叶片形态多样性研究[J]. 浙江农业科学, 2016, 1(2): 194-.
[10]	杨叶君，杨泽佳，李艳琴，唐怡洁，戴金丽，项缨*. 山桐子绿化容器移栽苗栽培试验[J]. 浙江农业科学, 2014, 1(12): 1888-.
[11]	黄小云;陶鹏;王五宏;李必元;岳智臣;雷娟利;钟新民. 结球甘蓝离体叶片不定芽的再生研究[J]. , 2014, 1(1): 0-38..
[12]	卢翔;夏海涛;陈秋夏;李效文;王金旺. 不同施肥处理对山桐子容器育苗的影响[J]. , 2014, 1(1): 0-65.
[13]	应俊杰;项加青;顾慧芬;张惠琴. 摘除低功能叶片对油菜菌核病的影响[J]. , 2013, 1(2): 0-193.
[14]	刘锋;孙本普;李秀云. 春玉米叶片数积温及其在生产中的应用[J]. , 2012, 1(5): 0-630.
[15]	张浩. 花宝5号肥液对玉树叶片扦插及生长的影响[J]. , 2012, 1(11): 0-1535.