芋种质叶绿体基因trnH-psbA序列特征及遗传多样性分析

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20211148

摘要/Abstract

摘要：

为探讨浙江省不同地源芋种质的分化与遗传多样性,对30份来自不同县市的地方芋种的trnH-psbA序列进行克隆、拼接,并对序列进行多态性分析和不同地源遗传距离计算以及聚类分析。结果表明:30份芋种质trnH-psbA序列的长度为730~739 bp,保守位点有717个,多态性位点13个,均为自裔位点,插入/缺失位点有3个;共有3种类型序列,可分为2种单倍型,单倍型多样性为0.457 06,不同地源遗传距离变化小,为0~0.018 1,平均遗传距离为0.005 2;聚类分析可将所有芋资源分为2个类群,不同的芋资源存在一定的地理隔离,且与芋的类型相关。本研究对不同地源芋质进行trnH-psbA序列分析,进一步明确了地方小种存在丰富的遗传多样性,为芋种质分子标记开发与保护利用提供理论依据。

关键词: 芋种质, trnH-psbA, 遗传多样性, 浙江

中图分类号:

Q949.28

洪霞, 陈孝赏, 王娇阳, 屈为栋, 邱莉萍, 陈银龙. 芋种质叶绿体基因trnH-psbA序列特征及遗传多样性分析[J]. 浙江农业科学, 2021, 62(11): 2274-2276.

图/表 3

参考文献 18

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编号	名称	来源	类型
1	沙埠芋	台州黄岩	紫黑柄多子芋
2	三甲芋	台州椒江	深绿柄多子芋
3	白芋	宁波象山	绿柄多子芋
4	芋头	温州苍南	乌绿柄多子芋
5	芋艿	温州龙湾	乌绿柄多子芋
6	党山红芋艿	萧山党山	黄绿柄多子芋
7	衢州红芋	衢州	乌绿柄魁芋
8	仙居早芋	台州仙居	紫黑柄多子芋
9	乌杆芋	台州临海	深绿柄多子芋
10	芋头	台州温岭	绿柄多子芋
11	红芋	台州黄岩	乌绿柄多子芋
12	香芋	台州黄岩	深绿柄多子芋
13	芋艿	丽水龙泉	深绿柄多子芋
14	毛芋	丽水莲都	深绿柄多子芋
15	人头芋	温州瑞安	绿柄魁芋
16	切芋	金华浦江	深绿柄多子芋
17	六月红水芋	温州苍南	绿柄多子芋
18	仙居乌杆早芋	台州仙居	紫黑柄多子芋
19	姜芋	宁波宁海	深绿柄魁芋
20	早黄芋	台州温岭	紫黑柄多子芋
21	土紫芋	金华浦江	紫黑柄多子芋
22	青秆芋艿	湖州安吉	绿柄多子芋
23	水芋	温州瑞安	紫红柄魁芋
24	芋	嘉兴平湖	绿柄多子芋
25	鼻涕芋	温州苍南	绿柄多子芋
26	红芋	杭州淳安	紫黑柄多子芋
27	满田生	温州文成	乌绿柄多子芋
28	水芋	温州瑞安	紫红柄魁芋
29	芋艿	衢州衢江	紫红柄多子芋
30	毛芋	丽水庆元	紫红柄多子芋

编号	名称	来源	类型
1	沙埠芋	台州黄岩	紫黑柄多子芋
2	三甲芋	台州椒江	深绿柄多子芋
3	白芋	宁波象山	绿柄多子芋
4	芋头	温州苍南	乌绿柄多子芋
5	芋艿	温州龙湾	乌绿柄多子芋
6	党山红芋艿	萧山党山	黄绿柄多子芋
7	衢州红芋	衢州	乌绿柄魁芋
8	仙居早芋	台州仙居	紫黑柄多子芋
9	乌杆芋	台州临海	深绿柄多子芋
10	芋头	台州温岭	绿柄多子芋
11	红芋	台州黄岩	乌绿柄多子芋
12	香芋	台州黄岩	深绿柄多子芋
13	芋艿	丽水龙泉	深绿柄多子芋
14	毛芋	丽水莲都	深绿柄多子芋
15	人头芋	温州瑞安	绿柄魁芋
16	切芋	金华浦江	深绿柄多子芋
17	六月红水芋	温州苍南	绿柄多子芋
18	仙居乌杆早芋	台州仙居	紫黑柄多子芋
19	姜芋	宁波宁海	深绿柄魁芋
20	早黄芋	台州温岭	紫黑柄多子芋
21	土紫芋	金华浦江	紫黑柄多子芋
22	青秆芋艿	湖州安吉	绿柄多子芋
23	水芋	温州瑞安	紫红柄魁芋
24	芋	嘉兴平湖	绿柄多子芋
25	鼻涕芋	温州苍南	绿柄多子芋
26	红芋	杭州淳安	紫黑柄多子芋
27	满田生	温州文成	乌绿柄多子芋
28	水芋	温州瑞安	紫红柄魁芋
29	芋艿	衢州衢江	紫红柄多子芋
30	毛芋	丽水庆元	紫红柄多子芋

类型	芋种质编号	碱基位点
		1	3	3	3	4	4	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6
		3	3	8	9	0	0	3	3	3	3	3	3	3	4	4	4	9	9	9	9	0	0	0	1	1	1	1	2	2	2	2	2	2	3	3	8
		1	9	6	3	3	4	3	4	5	6	7	8	9	0	1	2	5	6	7	8	1	4	9	0	7	8	9	0	1	2	3	4	8	3	4	4
Ⅰ	1~2、6~21、26、29~30	G	-	G	A	A	A	C	T	A	T	A	T	A	T	A	T	-	-	-	-	G	A	A	T	-	-	-	-	-	-	-	-	G	T	T	T
Ⅱ	3、22、24~25	·	-	·	·	·	·	-	-	-	-	-	-	·	·	·	·	-	-	-	-	G	A	A	T	-	-	-	-	-	-	-	-	G	T	T	T
Ⅲ	4~5、23、27~28	A	A	A	C	T	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	T	A	A	T	G	A	T	T	A	T	A	A	A	T	A	A	A	A

类型	芋种质编号	碱基位点
		1	3	3	3	4	4	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6	6
		3	3	8	9	0	0	3	3	3	3	3	3	3	4	4	4	9	9	9	9	0	0	0	1	1	1	1	2	2	2	2	2	2	3	3	8
		1	9	6	3	3	4	3	4	5	6	7	8	9	0	1	2	5	6	7	8	1	4	9	0	7	8	9	0	1	2	3	4	8	3	4	4
Ⅰ	1~2、6~21、26、29~30	G	-	G	A	A	A	C	T	A	T	A	T	A	T	A	T	-	-	-	-	G	A	A	T	-	-	-	-	-	-	-	-	G	T	T	T
Ⅱ	3、22、24~25	·	-	·	·	·	·	-	-	-	-	-	-	·	·	·	·	-	-	-	-	G	A	A	T	-	-	-	-	-	-	-	-	G	T	T	T
Ⅲ	4~5、23、27~28	A	A	A	C	T	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	T	A	A	T	G	A	T	T	A	T	A	A	A	T	A	A	A	A

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