基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20190620

浙江农业科学 ›› 2019, Vol. 60 ›› Issue (6): 911-914.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20190620

基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建

倪维晨¹, 李瑞霞¹, 陶启威¹, 张戟², 毕研飞³, 钱春桃^1,4,*

1.南农大(常熟)新农村发展研究院有限公司,江苏苏州 215500;
2.常熟市农业科学研究所,江苏苏州 215500;
3.江苏常熟国家农业科技园区管理委员会,江苏苏州 215500;
4.南京农业大学,江苏南京 210095

收稿日期:2019-04-11 出版日期:2019-06-11
通讯作者: 钱春桃(1969—),男,江苏扬州人,博士,研究方向为遗传育种,E-mail: chuntaoq@njau.edu.cn。
作者简介:倪维晨(1988—),男,山东临沂人,硕士,研究方向为生物技术,E-mail: niwchen@163.com。
基金资助:
常熟市科技计划项目(CN201803); 常熟市科技计划项目(CN201705)

Received:2019-04-11 Online:2019-06-11

摘要/Abstract

摘要： 利用30对SSR引物检测常熟市糯性鲜食小玉米自交系,有20对引物扩增出多态性特异条带,基于扩增带型清晰、稳定和易于统计及每条染色体上均匀分布原则,从中筛选10对引物作为构建10份糯性小玉米自交系指纹图谱的核心引物。结果表明:10对引物共扩增出39个条带,每对引物检测到条带2~6个,平均为3.9个。相似系数在0.1~0.7。聚类分析表明,10对引物可将10份糯性小玉米自交系区分开来。初步构建了常熟市10个糯性小玉米自交系的指纹图谱。

关键词: 糯玉米, 自交系, SSR标记, 指纹图谱

中图分类号:

S513

倪维晨, 李瑞霞, 陶启威, 张戟, 毕研飞, 钱春桃. 基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(6): 911-914.

参考文献

[1] 赵雅楠,王颖,张东杰,等. 基于SSR技术的水稻DNA指纹图谱构建[J]. 黑龙江八一农垦大学学报, 2016,28(5): 32-35.
[2] 李青燕,陈向东,董娜,等. 利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱[J]. 江苏农业科学, 2016,44(9): 32-34.
[3] 姚丹青,楼坚锋,顾芹芹,等. 上海地区玉米品种DNA指纹图谱采集及数据分析[J]. 上海农业学报, 2018,34(4): 11-15.
[4] 辛景树. 杂交玉米品种DNA指纹图谱[M]. 北京: 中国农业科学技术出版社, 2004: 196.
[5] 赵久然,王凤格,郭景伦,等. 中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究Ⅱ.适于玉米自交系和杂交种指纹图谱绘制的SSR核心引物的确定[J]. 玉米科学, 2003,11(2): 3-5.
[6] 黄芸萍,李林章,王迎儿,等. 宁波市蔬菜地方种质资源的收集利用及建议[J]. 中国蔬菜, 2018(3): 13-15.
[7] 赵军华,吕学高,楼肖成,等. 浙江省玉米地方种质表型多样性分析[J]. 浙江农业科学, 2015(5): 741-744.
[8] 王庆彪,张扬勇,庄木,等. 中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建[J]. 中国农业科学, 2014,47(1): 111-121.
[9] 卢媛,韩晴,王义发,等. 糯玉米品种‘沪玉糯3号’种子真实性与纯度鉴定的SSR核心引物筛选[J]. 上海农业学报, 2018,34(3): 45-49.
[10] 邸仕忠,孙小红,罗永统,等. 重庆市常用及新选玉米自交系SSR指纹图谱构建[J]. 安徽大学学报(自然科学版),2015,39(5): 96-102.
[11] 吕学高,赵军华,卢华兵,等. 浙江省玉米地方种质的SSR聚类分析[J]. 浙江农业科学, 2017,58(8): 1318-1321.
[12] MATSUOKA Y, VIGOUROUX Y, GOODMAN M M, et al.A single domestication for maize shown by multilocus microsatellite genotyping[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2002, 99(9): 6080-6084.
[13] 刘涛,胡萍,赵德刚,等. 黔东南地方玉米品种SSR分子标记指纹图谱构建[J]. 种子, 2010,29(9): 24-26.
[14] 李世风,步迅,梁水美,等. 甘肃部分玉米自交系SSR遗传多样性分析[J]. 中国农学通报, 2016,32(3): 91-99.

[1]	韩晴, 田东, 卢媛, 郑洪建, 沈雪芳. 施氮量对糯玉米农艺性状、产量与品质的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(9): 1733-1734.
[2]	任梦云, 杜龙岗, 王美兴, 黄益峰. 不同收获时间对甜糯双隐性玉米自交系种子质量的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(9): 1753-1756.
[3]	邵健丰, 邹桂花, 翟国伟. 帚高粱分子标记遗传图谱的构建[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(8): 1522-1524.
[4]	武婷, 郭诚, 巫水钦, 俞洋, 钟六凤, 俞金龙. 应用SSR标记鉴定甜瓜流星翡翠的种子纯度[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 841-842.
[5]	何金宇, 刘玉洋, 徐靖, 王晓彤, 陈晓俊, 王慧中, 卢江杰. 灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 967-973.
[6]	赵琳, 石江, 骆乐谈. 甜糯玉米钱江糯3号高产制种技术[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(4): 635-636.
[7]	谭禾平, 赵福成, 包斐, 韩海亮, 王桂跃. 密度对糯玉米浙糯玉14植株性状、功能叶SPAD值及果穗的影响[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(12): 2319-2320.
[8]	杜龙岗, 王美兴, 黄益峰, 任梦云, 陈珊宇, 曹栋栋. 甜加糯玉米科糯2号的选育及栽培技术[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(11): 2010-2012.
[9]	刘玉洋, 徐靖, 何金宇, 刘朋丽, 史钰军, 王慧中, 卢江杰. 铁皮石斛和金钗石斛杂交后代的分子鉴定[J]. 浙江农业科学, 2018, 59(9): 1709-1713.
[10]	陆虎华, 郝德荣, 薛林, 石明亮, 陈国清, 冒宇翔, 胡加如, 黄小兰, 张振良, 周广飞. 热带糯玉米种质T2的选育与利用[J]. 浙江农业科学, 2018, 59(7): 1098-1100.
[11]	田甜, 韩蕊莲, 梁宗锁. 不同产地和不同年限黄芩HPLC指纹图谱研究[J]. 浙江农业科学, 2018, 59(3): 370-376.
[12]	石益挺, 袁亚明, 何晓汀, 张月中, 俞炎良. 甜糯玉米新甜糯88的选育及应用[J]. 浙江农业科学, 2018, 59(2): 220-221.
[13]	刘玉洋, 叶生月, 闵会, 王慧中, 卢江杰. 槐叶决明SSR标记开发与应用[J]. 浙江农业科学, 2018, 59(2): 279-282.
[14]	吴新义, 吴晓花, 徐沛, 汪宝根, 鲁忠富, 余晓虹, 李国景. 瓠瓜浙蒲8号DNA指纹图谱构建及纯度检测[J]. 浙江农业科学, 2017, 58(7): 1150-1152.
[15]	刘士辉, 李怀志, 沈若刚, 葛海燕, 陈火英, 王兆龙. 石斛种质资源遗传多样性的SSR分析及指纹图谱构建[J]. 浙江农业科学, 2017, 58(7): 1183-1185.

基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价