优质常规粳稻浙禾622的多种病害抗性基因分子分析

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20230379

摘要/Abstract

摘要：

稻瘟病、白叶枯病以及条纹叶枯病是危害水稻的重要病害,严重影响稻谷产量与品质,因此,培育优质多抗水稻品种并解析其抗病分子机理具有重要意义。本研究以优质多抗常规粳稻浙禾622为材料,利用稻瘟病、白叶枯病以及条纹叶枯病的抗性基因功能型或紧密连锁标记,并结合PCR克隆及测序分析,明确该品种携带多种病害的抗性基因,浙禾622中携带Pi36、Pi50、Pizt、Pi63、Pib、Pi64、Pish、Pi37、Ptr、Pikm2和Pi35等抗稻瘟病基因,Xa25、Xa23和Xa14等抗白叶枯病基因,以及抗条纹叶枯病基因STV11。这些结果将为该品种的推广应用及进一步遗传改良奠定理论基础。

关键词: 水稻, 浙禾622, 病害, 抗性基因, 分子标记

中图分类号:

S511

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图/表 6

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基因	上游引物	下游引物	片段大小/bp	内切酶
Pi37	ATTCACGCAACCAGGGGGATA	TCGCAACTCATATCCCTTCTG	716(R)	—
Pit	ATGATAACCTCATCCTCAATAAGT	AAGCACCAAGTGGCGCCA	590(S)	—
Pish	GATCGATCATGGCCAGAGAG	ACAGCAGGTTGATGAGGACC	207(R)	—
Pi35	GCGTACAGCGTTCGCTCTATA	CTTCAAAAGCTCACAACCA
	CCGTCCTCCCTCCAGCATATATGTAT	CTGCAAAACAAAGGAAACGTG	535+317(R)	—
		AAGGGATGCAGGATAAAGAATGAA	535+266(S)	—
Pi64	TCCTGTGTTTCCTACCGAGTCCAGC	AGAGGAGTGCAAGGTTACCAGAGCC	1016(R)	—
Pib	GAACAATGCCCAAACTTGAGA	GGGTCCACATGTCAGTGAGC	365(R)	—
Pi63	TGGCTATCTGGTCTCCGTG	TCCAGATCAGGGCAGTTAGA	614(R)	—
Pi2	CAGCGATGGTATGAGCACAA	CGTTCCTATACTGCCACATCG	450(R)/282(S)	—
Pi9	GCTGTGCTCCAAATGAGGAT	GCGATCTCACATCCTTTGCT	397(S)/291(R)	—
Pizt	ATGTGGATGCTGTGTTAT	TAGTTTGCTGCTCAATAAGTA	176(R)	—
Pi50	TTGCACATGGTGCTGGATGG	GATCTTCCTCGAAAGAGCTG	1260(R)	—
Pi36	ATCATGGCAAATACTCGAAAG	CATATCATGAACACGACAACC	628(R)	—
Pi5	ATAGATCATGCGCCCTCTTG	TCATACCCCATTCGGTCATT	307(S)/206(R)	—
Pi56	TGCAAGAACCCTCCTCCTAC	CCTGCCATCTCAAGACTCTC	725(S)	—
Pita	GCAGGTTATAAGCTAGCTAT	GCCAAATAGCCAATTCATA	240+179(S)	—
	CAAGAGAGAGTATTTGCTTAGGAGT	CCTATATCTCTTTAAAATATGTTTGGC	240+104(R)	—
Pid3	TACTACTCATGGAAGCTAGTTCTC	AGCACTTCTTGACTACTGTCTGCC	658	BamHI
Pi1	GGTTGGTCGAAACCAGAAAA	GCTGAGGTAGAAGCGGGAGC	220(R)/209(S)	—
Pia	GCTCCTTCTTCAATTACTGGGAATGGTCGA	CTTGCAGTATCTCAAACTGG	119(S)/89(R)	SalI
Pid4	CCGCATCTCCTCCTTCCTCT	AGAGATCTCGCTGTTCAGTC	352(S)/279(R)	—
Pik	GGAAAGCTGATATGTTGTCG	ACTCGGAGTCGGAGAGTCAG	1650(R)	—
Pikm2	CAGTAGCTGTGTCTCAGAACTATG	AAGGTACCTCTTTTCGGCCAG	332(S)/290(R)	—
Pigm	CCTTGTTCCTCCTGCTATC	ATCTCGCTGTTCAGTCTTG	220(R)	—
Ptr	TGCAGATTTGACTGCTCGGT	GGGATCTTCCTCGCCCAAA	200(R)	—
Pikm2(测序)	GAGATCCTCCGCAATTTACC	TACTACGGGACCATGGTAAG	601	—
Xa5	CCGGAGCTCGCCATTCAAGTTCTTG	TGCTCTTGACTTGGTTCTCC	170(S)/145(R)	—
Xa10	CGCAATCACTTCAATTACTT	GAAGAATGAAAGAGGAGGG	270(R)	—
Xa13	AGCTCCAGCTCTCCAAATG	GGCCATGGCTCAGTGTTTAT	490(R)/281(S)	—
Xa21	CGATCGGTATAACAGCAAAAC	TCTGATCATGCATGTTCTGTG	574(R)/447(S)	—
Xa23	CTCTTCCCTGAGTCAAAGTC	GGAGAATAACCATCTTGTCG	640(R)	—
Xa1	CACATCACGGCCTCAAGTATCT	TCTCCATAACCACTGATTGCG	472(R)	—
Xa7	GGGAGAAATTGGCCCCAGTTAGAGAA	GCTTCACTTGATCACTGCTGTTTG	531(S)/306(R)	—
STV11(测序)	CTGCACAGTGCACACGATAC	ATAATAGATAGATAGATAGATA	1222	—
STV11	GACATGGCCGAGCTCATC	GGAGATGGCGAAGGTGGA	312(S)	SmaI
			211+101(R)
STV11	TGAAGGGTGTCACAACGAGC	GGAGGAAGAGGACCTTCTC	180(S)/169(R)	SacI
Xa25(测序)	CACTACATCTCTTCCCTTCA	CTTGTCTCCTCCAAGTTTGC	1154	—
Xa14	GGCTTCCTTCTTCACTTACCTGT	GCAGCGTTTTTAGGGAATCA	608(R)	—

基因	上游引物	下游引物	片段大小/bp	内切酶
Pi37	ATTCACGCAACCAGGGGGATA	TCGCAACTCATATCCCTTCTG	716(R)	—
Pit	ATGATAACCTCATCCTCAATAAGT	AAGCACCAAGTGGCGCCA	590(S)	—
Pish	GATCGATCATGGCCAGAGAG	ACAGCAGGTTGATGAGGACC	207(R)	—
Pi35	GCGTACAGCGTTCGCTCTATA	CTTCAAAAGCTCACAACCA
	CCGTCCTCCCTCCAGCATATATGTAT	CTGCAAAACAAAGGAAACGTG	535+317(R)	—
		AAGGGATGCAGGATAAAGAATGAA	535+266(S)	—
Pi64	TCCTGTGTTTCCTACCGAGTCCAGC	AGAGGAGTGCAAGGTTACCAGAGCC	1016(R)	—
Pib	GAACAATGCCCAAACTTGAGA	GGGTCCACATGTCAGTGAGC	365(R)	—
Pi63	TGGCTATCTGGTCTCCGTG	TCCAGATCAGGGCAGTTAGA	614(R)	—
Pi2	CAGCGATGGTATGAGCACAA	CGTTCCTATACTGCCACATCG	450(R)/282(S)	—
Pi9	GCTGTGCTCCAAATGAGGAT	GCGATCTCACATCCTTTGCT	397(S)/291(R)	—
Pizt	ATGTGGATGCTGTGTTAT	TAGTTTGCTGCTCAATAAGTA	176(R)	—
Pi50	TTGCACATGGTGCTGGATGG	GATCTTCCTCGAAAGAGCTG	1260(R)	—
Pi36	ATCATGGCAAATACTCGAAAG	CATATCATGAACACGACAACC	628(R)	—
Pi5	ATAGATCATGCGCCCTCTTG	TCATACCCCATTCGGTCATT	307(S)/206(R)	—
Pi56	TGCAAGAACCCTCCTCCTAC	CCTGCCATCTCAAGACTCTC	725(S)	—
Pita	GCAGGTTATAAGCTAGCTAT	GCCAAATAGCCAATTCATA	240+179(S)	—
	CAAGAGAGAGTATTTGCTTAGGAGT	CCTATATCTCTTTAAAATATGTTTGGC	240+104(R)	—
Pid3	TACTACTCATGGAAGCTAGTTCTC	AGCACTTCTTGACTACTGTCTGCC	658	BamHI
Pi1	GGTTGGTCGAAACCAGAAAA	GCTGAGGTAGAAGCGGGAGC	220(R)/209(S)	—
Pia	GCTCCTTCTTCAATTACTGGGAATGGTCGA	CTTGCAGTATCTCAAACTGG	119(S)/89(R)	SalI
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Pik	GGAAAGCTGATATGTTGTCG	ACTCGGAGTCGGAGAGTCAG	1650(R)	—
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Pikm2(测序)	GAGATCCTCCGCAATTTACC	TACTACGGGACCATGGTAAG	601	—
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Xa10	CGCAATCACTTCAATTACTT	GAAGAATGAAAGAGGAGGG	270(R)	—
Xa13	AGCTCCAGCTCTCCAAATG	GGCCATGGCTCAGTGTTTAT	490(R)/281(S)	—
Xa21	CGATCGGTATAACAGCAAAAC	TCTGATCATGCATGTTCTGTG	574(R)/447(S)	—
Xa23	CTCTTCCCTGAGTCAAAGTC	GGAGAATAACCATCTTGTCG	640(R)	—
Xa1	CACATCACGGCCTCAAGTATCT	TCTCCATAACCACTGATTGCG	472(R)	—
Xa7	GGGAGAAATTGGCCCCAGTTAGAGAA	GCTTCACTTGATCACTGCTGTTTG	531(S)/306(R)	—
STV11(测序)	CTGCACAGTGCACACGATAC	ATAATAGATAGATAGATAGATA	1222	—
STV11	GACATGGCCGAGCTCATC	GGAGATGGCGAAGGTGGA	312(S)	SmaI
			211+101(R)
STV11	TGAAGGGTGTCACAACGAGC	GGAGGAAGAGGACCTTCTC	180(S)/169(R)	SacI
Xa25(测序)	CACTACATCTCTTCCCTTCA	CTTGTCTCCTCCAAGTTTGC	1154	—
Xa14	GGCTTCCTTCTTCACTTACCTGT	GCAGCGTTTTTAGGGAATCA	608(R)	—

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