南瓜种质资源遗传多样性的SSR分析

doi:10.16178/j.issn.0528-9017.20170721

浙江农业科学 ›› 2017, Vol. 58 ›› Issue (7): 1161-1165.DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20170721

南瓜种质资源遗传多样性的SSR分析

王迎儿¹, 邢乃林¹, 应泉盛¹, 张慧波^{1, 2}, 黄芸萍¹, 王毓洪^{1, *}

1.宁波市农业科学研究院蔬菜研究所,浙江宁波 315040;
2.浙江农林大学农业与食品科学学院,浙江杭州 311300

收稿日期:2017-04-25 出版日期:2017-07-15
通讯作者: 王毓洪,E-mail:yhwangsc@163.com。
作者简介:王迎儿(1985—),女,浙江宁波人,农艺师,硕士,从事瓜类砧木育种工作,E-mail:wangyinger0601@sina.com。
基金资助:
宁波市科技富民惠民项目(2015C10053); 国家西甜瓜产业技术体系(CARS-26); 宁波市瓜菜育种重点实验室(2014A22007)

Received:2017-04-25 Online:2017-07-15

摘要/Abstract

摘要： 以主要来源于浙江省的41份南瓜种质资源为材料,利用26对南瓜SSR标记对其进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果表明,41份种质被分为4类,2类为白籽南瓜(各1份),1类中国南瓜(35份),1类印度南瓜(4份)。材料间的遗传相似系数介于0.45~0.96,平均为0.79。其中,中国南瓜类群种内平均相似系数为0.86,印度南瓜类群种内平均相似系数为0.67,这2个类群间的平均相似系数为0.54。所收集的浙江省种质资源除其中2份外,均被分类为中国南瓜,平均遗传相似系数为0.87。中国南瓜的亲缘关系较印度南瓜近,种内亲缘关系较种间近。研究结果对浙江省南瓜种质资源保护和开发利用具有重要意义。

关键词: 南瓜, 种质资源, SSR, 聚类分析, 遗传相似性

中图分类号:

S642.1

王迎儿, 邢乃林, 应泉盛, 张慧波, 黄芸萍, 王毓洪. 南瓜种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 浙江农业科学, 2017, 58(7): 1161-1165.

参考文献

[1] 魏瑛, 董秀珍. 南瓜特性与种类述略[J]. 北方园艺, 1997 (6): 17-19.
[2] 王鸣. 南瓜属:多样性(diversity)之最[J]. 中国瓜菜, 2002 (3): 42-45.
[3] 张箭. 南瓜发展传播史初探[J]. 烟台大学学报(哲学社会科学版), 2010, 23(1): 100-108.
[4] 吴元奇, 郑灵, 荣廷昭. 西南地区白玉米地方种质资源分布及遗传多样性[J]. 草业学报, 2013, 22(4): 160-169.
[5] CARPUTO D, ALIOTO D, AVERSANO R, et al. Genetic diversity among potato species as revealed by phenotypic resistances and SSR markers [J]. Plant Genetic Resources, 2013, 11(2): 131-139.
[6] FRANCESCO E, SILVIA L, LUKASZ G, et al. Genetic diversity and population structure assessed by SSR and SNP markers in a large germplasm collection of grape [J]. BMC Plant Biology, 2013, 13(1): 39.
[7] 孙正海, 李跃建, 宋明,等. 南瓜属三个种种质的遗传多样性[J]. 西南农业学报, 2004, 17(1): 71-73.
[8] 刘小俊, 李跃建, 赵云, 等. 中国部分栽培南瓜种质资源遗传多态性RAPD分析[J]. 西南农业学报, 2004, 17(5): 567-571.
[9] 李俊丽, 向长萍, 张宏荣, 等. 南瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析[J]. 园艺学报, 2005, 32(5): 834-839.
[10] 蔡宝炎. 32份中国南瓜种质资源的遗传多样性研究[D]. 武汉: 华中农业大学, 2006.
[11] 李海英, 赵晓萌, 赵福宽, 等. 适于南瓜遗传多样性分析的RAPD引物筛选[J]. 北方园艺, 2006 (1): 20-22.
[12] 褚盼盼, 向长萍, 张称心, 等. 中国南瓜种质资源农艺性状与RAPD标记分析[J]. 核农学报, 2007, 21(5): 441-446.
[13] 肖祖梅. 观赏南瓜种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析[D]. 重庆: 西南大学, 2008.
[14] 杨正安, 孟平红, 代贤, 等. 云南黑籽南瓜种质遗传多样性的RAPD和ISSR分析[J]. 植物遗传资源学报, 2011, 12(6): 860-864.
[15] 张天明. 南瓜种质资源多样性及亲缘关系的AFLP分析[D]. 北京: 中国农业科学院, 2005.
[16] LIU C, GE Y, WANG D J, et al. Morphological and molecular diversity in a germplasm collection of seed pumpkin [J]. Scientia Horticulturae, 2013, 154(2): 8-16.
[17] KONG Q, CHEN J, LIU Y, et al. Genetic diversity of Cucurbita , rootstock germplasm as assessed using simple sequence repeat markers [J]. Scientia Horticulturae, 2014, 175(1): 150-155.
[18] 李鹤, 郭世荣, 束胜, 等. 砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析[J]. 园艺学报, 2014, 41(7): 1379-1390.
[19] MAO W, XU Y, XU S, et al. Development of 19 transferable Cucurbita pepo EST-SSR markers for the study of population structure and genetic diversity in pumpkin ( Cucurbita moschata ) [J]. Plant Omics, 2014, 7(5): 345-352.
[20] 刘小俊, 李跃建, 梁根云, 等. 南瓜资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2010, 47(5): 1195-1200.
[21] 汤青林, 宋明, 肖祖梅, 等. 观赏南瓜及葫芦种质资源遗传多样性分子评价[J]. 植物遗传资源学报, 2012, 13(3): 406-413.
[22] MURRAY M G, THOMPSON W F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA [J]. Nucleic Acids Research, 1980, 8(19): 4321.
[23] KOFLER R. Microsatellites for the genus Cucurbita and an SSR-based genetic linkage map of Cucurbita pepo L. [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 117(1): 37-48.
[24] 李昕升, 王思明. 南瓜在中国的引种推广及其影响[J]. 中国历史地理论丛, 2014, 29(4): 81-92.
[25] ZHANG P Z, DREISIGACKER S A E, REIF J C, et al. Quantifying novel sequence variation and selective advantage in synthetic hexaploid wheats and their backcross-derived lines using SSR markers [J]. Molecular Breeding, 2005, 15(1): 1-10.
[26] 卢丽芳, 朱海生, 温庆放, 等. 南瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 热带作物学报, 2015, 36(12): 2142-2148.
[27] 朱海生, 卢丽芳, 陈敏氡, 等. 南瓜种质资源遗传多态性的ISSR分析[J]. 分子植物育种, 2015, 13(6): 1302-1308.

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[1]	邵健丰, 邹桂花, 翟国伟. 帚高粱分子标记遗传图谱的构建[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(8): 1522-1524.
[2]	王光锋, 何圣米, 邹宜静, 颜韶兵, 陈智, 甘良. 不同南瓜砧木嫁接对西瓜生长、产量及品质的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(8): 1548-1550.
[3]	丁兰, 许小江, 刘静, 牛骧, 黄伟忠. 南瓜制种单株留瓜个数对种子产量和质量的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(7): 1279-1281.
[4]	邢乃林, 王迎儿, 严蕾艳, 古斌权, 黄芸萍, 王毓洪. 淹水对南瓜砧木种质苗期生长发育的影响[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(6): 1106-1108.
[5]	张炯, 严斌, 高营, 薛晨晨, 陈新, 袁星星. 蚕豆种质资源主要农艺性状遗传多样性分析[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(6): 1109-1114.
[6]	武婷, 郭诚, 巫水钦, 俞洋, 钟六凤, 俞金龙. 应用SSR标记鉴定甜瓜流星翡翠的种子纯度[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 841-842.
[7]	尹晓蛟, 何银生, 王智, 吴德智, 周武先, 杨旭. 基于表型的重楼属种质遗传多样性分析[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 960-964.
[8]	何金宇, 刘玉洋, 徐靖, 王晓彤, 陈晓俊, 王慧中, 卢江杰. 灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(5): 967-973.
[9]	何海生, 刘金殿, 张爱菊, 郝雅宾, 孙翠萍, 于喆, 王俊, 罗伟, 肖善势, 周志明. 曹娥江不同江段鱼类的物种多样性和优势度[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(2): 359-364.
[10]	郁晓敏, 金杭霞, 袁凤杰. 浙江省大豆种质资源的收集与评价[J]. 浙江农业科学, 2020, 61(1): 26-28.
[11]	张蕾琛, 孙楠, 王迎儿, 应泉盛, 严蕾艳, 黄芸萍, 王毓洪, 王洁. 南瓜未授粉子房和胚珠离体培养影响因素[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(9): 1556-1560.
[12]	邢乃林, 付玉婧, 王迎儿, 应泉盛, 严蕾艳, 黄芸萍, 王毓洪. 淹水对南瓜、瓠瓜苗期生长发育的影响[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(7): 1115-1117.
[13]	倪维晨, 李瑞霞, 陶启威, 张戟, 毕研飞, 钱春桃. 基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(6): 911-914.
[14]	陈微, 潘美红, 惠林冲, 李威亚, 何林玉, 陈振泰, 缪美华, 杨海峰. 洋葱种质资源的研究[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(5): 723-726.
[15]	王伟科, 陆娜. 8个秀珍菇菌株遗传亲缘关系初步分析[J]. 浙江农业科学, 2019, 60(5): 727-729.